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分子工具在环境科学与工程领域的应用

11月23至24日,由vic67维多利亚3308生物学研究所主办的学术培训讲座——分子工具在环境科学与工程领域的应用(Molecular tools and the applications in the studies of environmental science and engineering)在节能楼311、705会议室举行。讲座邀请到美国伊利诺伊大学(University of Illinois at Urbana-Champaign)土木与vic67维多利亚3308的刘文佐(Wen-Tso Liu)教授,为大家进行为期两天的短期培训课程。培训讲座由环境生物学所副教授陆韻主持,来自学院的35名研究生、本科生和博士后老师参加了培训。

图为学术培训讲座现场。

刘教授是微生物生态学和分子生物学方面的专家。他首先向大家简要介绍了微生物生态系统,包括生物多样性、微生物功能及二者之间的联系。丰富的图示,有趣的动画,加上寓教于乐的互动题目,使大家对微生物系统、群落、集群、种群、物种的概念变得清晰起来。

图为刘文佐教授。

之后,刘教授讲解了分类学(taxonomy)的概念以及系统发育分析(phylogeny analysis)在微生物生态学研究中的重要性,除了微生物命名、分类、鉴定的基本知识之外,刘教授还着重介绍了利用生物信息学软件Mega4.0构建系统发育树(phylogeny tree)的过程。

图为实际上机学习软件使用。

了解微生物种群数量、组成及其变化是研究微生物生态学的前提。随后的培训中,刘教授就分子工具(Molecular tools)在微生物多样性(microbial diversity)研究中的应用进行了详细介绍,并对环境宏基因组技术、测序技术的发展做了展望。作为终端限制性片段长度多态性分析技术(T-RFLP)的发明者,刘教授用图示、文字以及互动练习的方式讲解了T-RFLP技术的原理、流程以及适用领域,大家在轻松的氛围中体会到分子生物学技术的奥妙。

图为课堂互动讨论。

短短两天的培训中,刘教授全英文、互动式的教学方式以及轻松自由的课堂气氛给大家留下了深刻印象。同学们从实验设计、软件操作乃至科研中的困惑等方面提出了许多问题,刘教授一一耐心作答,令人受益匪浅。同学们纷纷表示,通过此次培训,他们不仅获得了分子生物学的基本技能知识,更收获了一种科研的思路与方法。

刘文佐,美国伊利诺伊大学(University of Illinois at Urbana-Champaign)土木与vic67维多利亚3308教授,上海交通大学、新加坡国立大学访问教授。国际微生物生态学学会、美国微生物学会、国际水协会会员。研究方向为微生物生态学和分子微生物学在污水处理工艺中的研究。(文/贾倩倩,图/刘丽丽,编辑/苏珍爱)